日期

时间

授课题目

授课内容

4月9日（周四）

08:30-09:30 
  1h

报到
  开班仪式

安装软件
  测试网络

09:30-11:30
  2h

分子进化/生物信息分析内容/套路的详解

以SCI文章为例，具体学习分子进化研究中流行的分析思路和方法

13:00-15:00 
  2h

主流数据库使用 
  上机实践

重点学习在NCBI，UNIPROT，ENSEMBL网站中获取数据的方法和途径

15:00-17:30
  2.5h

同源家族成员查找

上机实践

重点学习如何在数据库中查找已知序列的同源信息和数据的获取。

4月10日（周五）
 
 

09:30-11:30 
  2h

同源家族成员比较分析

上机实践

在获取同源家族成员后进行相互比较，分析保守区域，获取重要功能位点，绘制sequence   logo图。

13:00-17:00
  4h

分子进化树构建

上机实践

学习分子进化树构建原理，MEGA软件的使用，对进化树的解读

17:00-17:30 
  0.5h

总结答疑

4月11日（周六）
 
 

9:30-11:30
  2h

基因功能注释

上机实践

学习GO,KEGG分析，绘制饼图，柱状图，通路图

13:00-15:00
  2h

蛋白2D结构分析

信号肽，跨膜结构分析，二级结构预测，结构域分析

15:00-17:00
  2h

蛋白3D结构分析

PDB数据库学习，3D结构模拟，绘图

17:00-17:30 
  0.5h

总结答疑

日期

4月16日（周四）
 
 

08:30-09:30 
  1h

报到
  开班仪式

安装软件
  测试网络

9:30-11:30
  2h

组学数据格式

1.  转录组学数据格式

2.  蛋白组学数据格式

13:00-14:00
  1h

物种数据获取

重点学习在NCBI，UNIPROT，ENSEMBL网站中获取数据的方法和途径

14:00-16:30
  2.5h

数据准备

1.  归一化

2.  PCA分析

3.  聚类分析

4.  差异数据筛选

16：30-17：30
  1h

SCI从撰写到投稿
  由SCI杂志审稿人主讲

SCI论文写作技巧，投稿和回复审稿人意见

日期

4月17日（周五）
 
 

单组数据分析

9:30-11:30
  2h

GO富集分析

学习GO数据结构，分析方法，绘制发表格式图片

13:00-15:00
  2h

KEGG信号通路富集分析

学习KEGG数据库的使用，学习解读KEGG信号通路图

绘制图片

15:00-16:30
  1.5h

蛋白互作分析

学习蛋白互作数据库STRING的使用，数据获取

16：30-17：30
  1h

共表达分析

学习计算pearson相关性，分析，聚类和绘图

日期

4月18日（周六）