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代谢组学方法在生物技术和生命科学中的进展

中文

2010-09-17 至 2010-09-17

上海

夏文秀

021-20205500

xia.wenxiu@mmi-shanghai.com

http://www.a-c.cn/Index.aspx

已过期
代谢组学方法在生物技术和生命科学中的进展

Metabolomic Approach for Biotechnology and Life Sciences


时间2010-9-17 13:30-16:30

TimeSeptember 17, 2010. 13:30-16:30

地点上海新国际博览中心W1馆W1-T2会议室

VenueHall W1, Room W1-T2 , Shanghai New International Expo Centre (SNIEC) , China

主办单位德国亥姆霍兹国家研究中心有机化学与分析部、德国慕尼黑国际博览集团

OrganizersDepartment of BioGeoChemistry and Analytics, Institut für kologische Chemie, Helmholtz Zentrum München, Germany/ Messe München International

简介从传统的人类健康定义出发,代谢组学主要对代谢过程中产生的中间物和最终产物的小分子(代谢分子)浓度进行测定。测试对象主要是各类生物样本和体液如尿液、唾液、血浆、组织样本等;甚至一次简单的呼吸(呼出气体的浓缩物)也能反映出健康状况。同样,该方法也可用于环境科学中对给定系统中的所有小分子在不同层面上进行历史记录,囊括生命体的代谢分子和他们所有的生物/非生物转化物的情况。目前,有机体代谢物的总数量仍然不甚清楚;科学家们的预计数量从几千到二十万甚至一百万不等,但有可能即便是百万级的估量也显得保守。如果我们把非有机物生存必需的植物和细菌等的代谢物(亦称次级代谢物)算进去,这个数据就会更加庞大。代谢物的可能数量远远大于对应的基因数量,因此,目前我们的代谢物数据库最多收纳了其总数的2%。在有机系统环境中的情况则更为复杂,因为生物和非生物的成岩反应使化学空间增大,就会产生更多类型的化学物。对代谢物进行分子层面上的系统分析需要使用分离技术、光谱学和光谱测量技术等高解析度分析手段。

AbstractFrom a traditional definition in the field of human health, metabolomics measures the concentrations of the large number of naturally occurring small molecules (called metabolites), that are produced as intermediates and end-products of all metabolic processes. They are measured from biological samples and body fluids such as urine, saliva, blood plasma, tissue sample; even the simple breath (exhaled breath condensates) can carry the information about the state of health. In environmental issues the same approach can be followed looking holistically to all small molecules detectable in a given systems in various scales, integrating thus metabolites from living organisms and all their biotic/abiotic transformation products. The total number of different organism metabolites is still unknown; some estimation ranges from a few thousands, up to 200,000 to about 1,000,000, but even this latter estimate may be conservative. Including plant and bacterial metabolites that are not necessary to keep the organism alive, also referred to as secondary metabolites, the number is enormously larger. The probable number of metabolites is also considerably larger than the number of corresponding genes, so it seems that the currently available databases cover at best 2% of the total number of existing metabolites. In environmental organic systems this becomes even more complex as biotic and abiotic diagenetic reaction increase the chemical space and thus chemical diversity. High resolution analytical technology involving separation sciences, spectroscopy and spectrometry for a metabolomic are needed for a description of a system on molecular level.

演讲嘉宾Dr. Philippe Schmitt-Kopplin