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10X Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班

汉语

2019-08-02 至 2019-08-04

北京

史老师

010-59341771

bcc-sxpx@bcc.ac.cn

10X Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班


细胞图谱构建、细胞亚群分析、稀有细胞类型鉴定、肿瘤微环境、肿瘤耐药性…,单细胞转录组测序技术已成为近几年非常热门的话题之一。同时,转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点?如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法?本课程一共3天,理论与实战相结合。培训内容包括单细胞制备技术、单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化、常规转录组测序数据分析、多组学数据整合挖掘分析、SCI论文图表整理。


主讲专家来自重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域研究工作,以第一作者发表过多篇生物学一区、二区TOP SCI论文(如:Plos Genetics;Plant Cell等)。精通python语言、R语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验,培训学员近2000人。


主办单位:北京市计算中心 
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 


北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 


工信部和信息化人才培养工程培训基地
中国生物工程杂志 


  地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼


 

课程安排:


2019年8月2-4日 上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00


 

主 题


简 介


第一天(理论+实操)


10X Genomics单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术


 

基因组、生物信息学相关的背景概述


10X Genomics单细胞转录组测序技术简介


单细胞悬浮液或原生质体制备技术


上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作)


图1.jpg 

第二天(理论+实操)


单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)


 

Cell ranger 质控


T-SNE聚类


如何确定细胞类群


如何寻找bio-marker


如何优化分析流程


图2.jpg

第三天(理论+实操)


多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路


 

 

 

多组学研究思路


多种作图方式结合


(综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片)


高分辨率SCI论文图片生成


(综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片)


数据重复性评估


(如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、Realtime PCR结果)


基因共表达网络构建与Cytoscape展示


多组数据表达趋势聚类及深度解析策略


图3.jpg

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。


(课程内容以实际授课为准)


【收费标准】


注册费:3900元/人,包括学费、资料费、上机费。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。培训期间,免费提供工作午餐。


【报名优惠政策】


1、 2019.7.15之前报名并缴费的学员每人可减少200元;
2、 3人以上团体报名每人可减少300元;
3、 4+1团报,可免费赠送一个名额;                
4、 上面几种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。


老学员参加及老学员推荐参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


【请联系】


QQ号:2814500767邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn


徐老师 010-5934178615801436028(微信同号)


员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)

【付费方式】


现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
  号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部??您的姓名”)


【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询。