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多组学数据分析及挖掘培训班

汉语

2019-09-05 至 2019-09-08

北京

史老师

010-59341771

bcc-sxpx@bcc.ac.cn

多组学数据分析及挖掘培训班


随着组学技术的快速发展,单一组学的数据难以系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制。通过多组学数据来解析科学问题变得尤为重要,SCI论文发表呈现出导向性的多组学整合发展趋势


那么


面对眼花缭乱的组学数据该如何分析?


怎样凝练或寻找自己的科学问题?


多组学实验如何设计?


利用组学数据如何发表高分SCI论文


为了解决研究者的困惑,我们隆重推出《多组学数据分析及挖掘培训班》,邀请具有多年生物信息和数据挖掘的科研项目经验的老师,为您答疑解惑,帮助您少走弯路,快速掌握处理多组学海量数据的基本技能和实用技巧。


主办单位:北京市计算中心 
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室


北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心


工信部和信息化人才培养工程培训基地
中国生物工程杂志


  地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼


课程内容:


201995-8 上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00


日期


上课时间


授课题目


授课内容


第一天


9:30-10:30


基因组学及生物信息学概述


1、基因组学与生物信息学背景知识介绍


2、生物信息进展与前沿技术介绍


10:40-12:00


组学技术介绍


基因组学,转录组学,表观组学,蛋白质组学,代谢组学及相关技术介绍


13:30-17:30


基因组学实验设计及数据分析


1、基因组重测序的理论与研究方法及意义


2、全基因组数据分析策略


3、全外显子组、目标区域测序策略与分析


4、经典文章解读与研究方案设计


第二天


9:30-12:00


转录组学实验设计及数据分析


1、转录组学研究的实验技术和分析基础


2、有reference转录组数据分析


3、无reference转录组数据分析


4、转录组高级数据分析(聚类、网络构建等)


5、经典文章解读与研究方案设计


13:30-17:30


表观组学实验设计及数据分析


1、表观遗传学实验数据的分析方法;


2DNA甲基化数据分析;


3、蛋白质与DNA相互作用研究;


4、经典文章解读与研究方案设计


第三天


9:30-12:00


蛋白质组学实验设计及数据分析


1、蛋白质组数据的鉴定和质量控制;


2、蛋白质谱搜库;


3、蛋白质组数据分析:同源映射(Blast)及蛋白ID转换,GO富集分析,Pathway分析;


4、蛋白互作(PPI)分析、功能作图及模型构建;


5、经典文章解读与研究方案设计


13:30-17:30


基因组和转录组整合分析思路及研究案例讲解


1DNA层面筛选的候选基因在转录水平的展示;


2RNA层面显著差异表达基因在基因组突变的分析;


3、关键基因的通路富集分析等;


第四天


9:30-12:00


lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练及研究案例讲解


1、差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA共有基因分析;


2、差异circRNA来源基因与差异 mRNA共有基因分析;


3、差异 miRNA靶基因与差异 mRNA共有基因分析;


4lncRNA-miRNA-mRNA联合分析;


5circRNA-miRNA-mRNA联合分析;


6ceRNA网络构建


13:30-15:30


DNA甲基化和RNA的联合分析


1DMR(差异甲基化修饰区域)相关基因与mRNA联合分析;


2DMP(差异甲基化修饰启动子)相关基因与mRNA联合分析;


15:40-17:30


蛋白组和代谢组在分子机制解析及标志物发掘中的应用


1、蛋白组和代谢组技术策略解析


2、多层组学整合思路探讨及研究案例讲解;


3、根据参考案例文章,应用免费软件完成发表级别图表绘制


注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。


(课程内容以实际授课为准)


讲课老师:


讲师团队具有丰富实践经验,由一线分析人员亲自授课。


裴老师,博士,北京市科学技术研究院副研究员,中国科学院北京市基因组所,博士后,北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。从事基因组与生物信息学研究多年,具有良好的遗传学及生物信息学研究背景与技术,具有大模型数据分析能力,从事关于遗传学、基因组学与生物信息学工作多年,具有大数据分析与机器学习技术工作经验。熟悉各种生物学与统计学专业软件与分析方法。具有较丰富的生物信息学数据分析、处理与高性能计算机的运用、程序开发及数据库平台构建工作经验。


刘老师,博士,助理研究员,博士毕业于中国科学院北京市基因组所, 北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。具有丰富的外显子组、转录组等测序数据分析,疾病基因组数据解读,公共数据库数据挖掘与二次开发经验。具有丰富的生物信息学技术培训授课经验。


袁老师,北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。精通perl、R、Python、Shell Script等编程语言,在Linux服务器运维、集群搭建、docker容器技术、数据库及网站搭建方面有一定经验,熟悉转录组相关的生物信息分析流程。


报名费用


注册费:5200元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。培训期间,免费提供工作午餐。


付费方式


现金、支票、银行转账、银行汇款


单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  


开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行


(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)


报名优惠政策


1、2019.8.17日前报名并缴费,可享受减免200元优惠;


2、3人以上团体报名每人可减少300元;


3、4+1团报,可免费赠送一个名额;


4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。


老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。


培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


请联系


QQ号:2814500767邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn


徐老师 010-5934178615801436028(微信同号)


员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)

开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询。


附:部分案例展示图


 转录组与蛋白组差异表达分析.jpg

转录组与蛋白组差异表达分析


 

DNA甲基化与基因表达分析.jpg 

DNA甲基化与基因表达分析


 

LnRNA表达与网络.jpg 

LnRNA表达与网络


 

 circRNA-miRNA-mRNA 之间 ceRNA网络调控网络图.jpg

circRNA-miRNA-mRNA之间ceRNA网络调控网络图